常规仪器不易区分天然颜色的托帕石与辐照处理致色的蓝色托帕石。如果蓝色托帕石有残余放射性则表明经过处理。但是样品经过较长时间的存放，其放射性残留量可以降低到安全标准以下，无法依此进行鉴别。另一种检测改色处理的蓝色托帕石的方法是热致发光。据U.Heen 和H.Bank(1990)研究，天然的蓝色托帕石热致发光的峰值有两个，分别位于250℃和500℃的温度，而且前者的发光强度大于后者。而幅照处理的蓝色托帕石，不论是用γ-射线，电子或中子中为幅照源，其热致发光的峰值却在400℃以后，并呈单峰的形式。更好的鉴定办法是最近袁心强等（2006）发现的阴极发光，天然蓝色托帕石具有比辐照处理的强很多的阴极发光。在2000年左右Co2＋离子扩散处理的托帕石在市场上出现，该种托帕石整体视觉颜色呈蓝绿色调，但蓝绿色调仅限于表层（厚度<5μm），内部无色，并且，表面不均匀地聚集有褐黄色斑点。这种蓝色托帕石的鉴定特征是滤色镜下呈橙红色，托帕石表面有不均匀聚集斑点及颜色浓集区。激光拉曼光谱中由Co2＋－O弯曲振动衍生的731、627、504cm-1三个宽谱带及200cm-1的锐峰。